K projednání stěžejních témat území kraje RSK vytváří pracovní skupiny. Pracovních skupin se vedle vybraných členů nebo jejich náhradníků účastní odborníci na projednávanou problematiku nebo zástupci organizací působících v dotčeném oboru nebo tematické oblasti.
Pracovní skupina Vzdělávání
Pracovní skupina Inovace
Pracovní skupina pro cestovní ruch
Pracovní skupina pro venkov
Pracovní skupina Brownfieldy